جاناتان لیوینگستون مرغ دریایی یک متفکر مستقل است که از نزاع های روزانه بر سر غذای ناچیز و بقای محض در گله مرغ های دریایی خود که هیچ حس عمیق تری از هدف ندارند، ناامید شده است.

بر خلاف همسالانش، او با اشتیاق به پرواز از همه نوع غرق می شود و روحش با آزمایش های هوایی و کسب اطلاعات بیشتر در مورد ماهیت بدن خود و محیط برای رسیدن به پرواز سریع تر و سریع تر، اوج می گیرد.

در نهایت، عدم انطباق او در گله باعث می شود که آن ها رسماً او را با برچسب “Outcast” طرد کنند.

جاناتان بدون دلسردی به تلاش های خود برای رسیدن به اهداف پروازی بزرگتر ادامه می دهد و متوجه می شود که اغلب موفق است.

او عمر طولانی شادی دارد و غمگین است نه به خاطر تنهایی اش، بلکه تنها به این دلیل که بقیه گله هرگز مانند او شکوه پرواز را نخواهند شناخت.

در دوران پیری، او با دو مرغ دریایی درخشان روبرو می شود که توانایی های او را به اشتراک می گذارند و به او توضیح می دهند که چیزهای زیادی یاد گرفته است، اما آمده اند تا او را به “خانه” ببرند، جایی که او “بالاتر” خواهد رفت.