در داستان شب طولانی ماجرای فرمانده ای روایت می شود که پس از اعزام به پایگاه جدید، برای جلوگیری از جنگ و درگیری میان ماهیگیرهای غیرقانونی ترکمن و ماموران خود، شروع به اعتمادسازی می کند اما می ترسد که تمام زحماتش بر سر دشمنی یکی از مامورانش با رئیس ماهیگیرهای غیرقانونی، از بین برود.