با شهامت ناروتو و کمی شانس، ناروتو، ساسوکه و ساکورا بخش کتبی امتحانات انتخابی نینجا را پشت سر گذاشتند. اما این تنها آغاز راه بود. آن ها اکنون در گیر و دار بخش دوم امتحان هستند که در جایی به نام جنگل مرگ برگزار می شود، و مربی آنکو میتاراشی عهد کرده است که تعداد تیم های پیشرو را به نصف برساند. هر تیم در مقابل سایرین قرار می گیرد تا با توسل به حرکات مخفیانه و حیله گری، طومارهایی را که برای قبولی در امتحان نیاز دارند بدزدد و در عین حال تلاش می کند تا از خطرات جنگل جان سالم به در ببرد. و اگر این کار کفایت نکند، یک دغل باز مرموز در بین شاگردان هست که می خواهد به ساسوکه آسیب برساند!